Bueno, he pasado horas buscando una respuesta y ya la tengo después de jugar varias temporadas:
Instalé el parche de ligas inferiores de España
Cree un nuevo club a partir de otro (no recuerdo cual) en 1º Regional Preferente.
Ascendí la primera temporada a 3ºRFEF. Me hice equipo profesional y se creó un equipo B.
Le metí jugadores y staff para que tuviera reputación y lo hacía de jugar amistosos constantemente.
Subí con el primer equipo hasta segunda división y desistí porque el equipo B nunca subió.
Al tener a un equipo en un nivel decente y no tener más que equipo A y juvenil (sin que haya previo paso del juvenil en el B), la diferencia entre juvenil y segunda division es alta, las cesiones no son una opción al jugar yo con plantillas cortas que requiere de jovenes constantemente por lesiones, sanciones o forma.
Solución?
Empezar nueva partida y crear un equipo que tenga equipo B en una división inferior.