Asturdavis

Al final, lo que acabo haciendo (y no siempre funciona, no se de que depende), es que como tengo el editor interno, aprovecho un vacío legal. 
Los jugadores del filial son jugadores tuyos al fin de cuentas, pero quizás el error resida en el movimiento entre plantillas. Por lo que  muchas veces, si el jugador por ejemplo en mi caso está en el Sporting Atlético, y me salta el mensaje de no jugabilidad, con el editor interno le doy a la opción de mover a otro club, y le muevo a ese mismo club, es decir, haces ver que el jugador deja de pertenecer a tu club, aunque al manarlo al mismo sitio, es este caso el filial, sigue siendo jugador tuyo.
Es una chapa hacerlo con todos los que surgen cada temporada, y se cambian condiciones de sueldos y contratos, y repito que no siempre funciona. Pero es la única solución si quieres que se sigan desarrollando en el filial, al menos que haya encontrado.
Los filiales siempre son un tema escamoso en el FM, y espero que en el de este año lo pulan un poco.